UZ Gent laboratoriumgids     Code of Stukje omschrijving
 
 
Hoofdmenu Labgids
  BIRC3 (BIRC3) BIRC3Verwijst naar: Mutatieanalyse van genen betrokken bij CLL d.m.v. NGS
   Afdeling: Moleculaire Diagnostiek: Hematologie    Pathologie: Chonische lymfatische leukemie (CLL)Aanvraagformulier:   Aanvraagformulier bijzondere hematologie - cytomorfologie | immunofenotypering | moleculaire analyses
Staaltype(s)BMU Beenmerg uitstrijkje , ECMD EDTA (paars) _ CMD LAB
Volume Beenmerg min. 1 mL, bloed 4 mL (min. 1 mL)
Uitvoering Wekelijks
Antwoordtijd max. 25 dagen
Afnamecondities Vers afgenomen; aparte EDTA tube
Verzending Binnen 2 dagen na afname
Methode Next Generation Sequencing (NGS)
Technische info
Technische informatie NGS:
- Mutatieanalyse gebaseerd op massive parallel sequencing of next generation sequencing (NGS); voor volledig panel (4 genen) zie informatie bij `Mutatieanalyse van genen betrokken bij CLL mbv NGS`
- Enkel varianten met een VAF (Variant Allele Frequency) van > 5% met klinische relevantie worden gerapporteerd.  
- RefSeq (NCBI): NM_001165.4 	
- Exon: 6-9
- Codon: alle
- Nucleotiden: c.1082-1815
- Coordinaten (chromosomale posities) van de nucleotiden van interesse (GRCh37/hg19): 11:102,201,732-102,207,836


Uitvoering:
De library preparation, sequenering, primaire en secundaire data-analyse wordt uitgevoerd door het platform Moleculaire Diagnostiek UZ Gent (MDG) (https://www.cmgg.be/nl/zorgverlener/labguide/platform-moleculaire-diagnostiek-uz-gent-mdg) 	

Belangrijke publicaties:
Nadeu, F., et al., Clinical impact of clonal and subclonal TP53, SF3B1, BIRC3, NOTCH1, and ATM mutations in chronic lymphocytic leukemia. Blood, 2016. 127(17): p. 2122-30.
Rossi, D., et al., Disruption of BIRC3 associates with fludarabine chemorefractoriness in TP53 wild-type chronic lymphocytic leukemia. Blood, 2012. 119(12): p. 2854-62.

 
Klinische info
Het BIRC3 (Baculovirus IAP repeat containing 3) gen is een lid van de IAP eiwitfamilie die apoptose inhibeert. Hierbij is het een negatieve regulator van de NF-κB signalisatie. Mutaties in dit gen komen niet zo vaak voor bij diagnose (4%) [Nadeu et al. 2016, Rossi et al., 2012), maar zijn wel frequenter (24%) bij patiŽnten met resistentie tegen fludarabine (Rossi et al., 2012). Wanneer mutaties in BIRC3 toch voorkomen bij diagnose, zijn ze gecorreleerd met een slechte prognose, vergelijkbaar met die van patiŽnten met een TP53 mutatie [Nadeu et al. 2016, Rossi et al., 2012). De meeste mutaties zijn frameshift mutaties die resulteren in een premature truncatie van het eiwit en komen voor in de 3í regio van het gen.
Opmerkingen
Belang pre-analytische fase - stabiliteit staal: 
Aparte, ongeopende EDTA buis voor moleculaire uitwerking.
Het staal moet binnen de 2 dagen na afname verzenden worden naar het Klinische Biologie, Labo Moleculaire Diagnostiek (MolHem) zodat dit binnen de 3 dagen na afname in het labo kan verwerkt worden. In tussentijd moet het staal in de koelkast bewaard worden (2-8įC). 

Terugbetaling:
Het opsporen van mutaties in BIRC3 gen valt onder de RIZIV verstrekking 588453-588464, waarbij genafwijkingen door middel van een moleculair biologische methode worden opgespoord in de diagnostische investigatiefase van een chronische lymfoÔde aandoening (waaronder CLL). 
 
Accreditatie Nee
Validatiedossier Ja
Verantwoordelijke Apr. biol. B. Denys
  Laatste bijwerking Glims: kevin op 1/03/2018 15:38   Laatste manuele bijwerking: BADE op 05/11/2019

Labogids www.uzgent.be/labgids